PyPy быстрее CPython в некоторых задачах в основном благодаря использованию JIT-компиляции (Just-In-Time). В то время как стандартный CPython является чистым интерпретатором (он поочередно выполняет байт-код), PyPy анализирует код прямо во время работы программы. Он находит "горячие" участки (например, циклы, которые выполняются тысячи раз) и на лету компилирует их в быстрый машинный код.

Данный вопрос является очень редким.

По сути, услышать его можно в двух случаях:

1. Человек, который задает этот вопрос, - это душнила, который хочет самоутвердиться с за счет тех, кто этого не знает или хочет найти таких же душнил-единомышленников.
2. В компании, в которую вы проходите собеседование, реально используют PyPy, и им нужен человек, который понимает, как он работает, чтобы писать эффективные и быстрые программы.

Как вы можете понять, первый вариант встречается в разы чаще второго.